Training mit dem EMST gilt als "aerosolbildende Maßnahme" und sollte daher von Infizierten nicht durchgeführt werden, wenn andere Personen im Raum sind. Andererseits bietet sich das Training mit dem EMST hervorragend als tele-therapeutische Maßnahme an, da die Patienten bei sich zu Hause trainieren können und vom Therapeuten aus der Praxis angeleitet und überwacht werden können. Auch die US-amerikanische Fachgesellschaft ASHA schlägt ein solches Vorgehen auf ihrer Homepage vor.

Patienten, die COVID-19 überstanden haben, könnten zudem von einem COVID-19-Rehabilitationsprogramm profitieren, um ihre durch Krankheit und Intensivstation geschwächte Atemmuskulatur wieder zu kräftigen und Ausdauer zurückzuerlangen.

Patienten mit akuten Atemwegssymptomen sollten aber immer ihren Arzt oder Therapeuten befragen, ob das Training mit dem EMST für sie sicher ist.